Temps partiel thérapeutique. - santé

J’ai été en arrêt de travail un an et 4 jours pour une hernie discale. Je bénéficie d’une reprise à mi-temps thérapeutique pour 3 mois. Ma collectivité m’a mise en congé à la fin de mon arrêt pour 1 mois et demi. Est ce que je perds 1 mois et demi de mi-temps où démarre t-il à la reprise effective. J’ai passé une visite médicale de reprise le jour de la reprise et non pas pendant mes congés, est-ce normal ?, merci.